Localizado en la región de los Lagos, en la parte occidental de la isla de Chiloé, el Parque Nacional Chiloé protege una zona rica en biodiversidad, cultura e historia, por lo que constituye un importante destino turístico de la isla y del sur de Chile. El año 2019, antes de la pandemia de COVID-19, el parque recibió un total de 48 162 visitantes.

Se embarca una área de 430,57 km² (166 sq mi) dividido en two sectores principales: lo más pequeño, que se llama Chepu, está en la comuna de Ancud, mientras lo demás, que se llama Anay, está en las comunas de Dalcahue, Castro, y Chonchi. Lo más grande porción del parque están en las estribaciones del Cordillera de la Costa de Chile, que se conoce como Cordillera del Piuchén. Incluye zonas de dunas, secciones del bosque Valdiviano, pantanos, y turberas. Una porción pequeña, Metalqui, es una islote con una área de 0.5 km² (0.19 sq mi).